逍遥八字网

当前位置:

网站首页

>

八字

>

> MEGA进化树 V7.0.26 免费版(MEGA进化树 V7.0.26 免费版怎么用)

MEGA进化树 V7.0.26 免费版(MEGA进化树 V7.0.26 免费版怎么用)

编辑:逍遥八字网 日期:2022-10-28 06:00:44 浏览:0
导读 关于MEGA进化树 V7.0.26 免费版,MEGA进化树 V7.0.26 免费版怎么用这个很多人还不知道,小鑫来为大家解答以上的问题,现在让我们一起来...

关于MEGA进化树 V7.0.26 免费版,MEGA进化树 V7.0.26 免费版怎么用这个很多人还不知道,小鑫来为大家解答以上的问题,现在让我们一起来看看吧!

  MEGA进化树是来自国外的一款操作便捷,功能强大的分子进化遗传分析软件,软件功能齐全,界面简单直观,新版本带来了更多的功能和改善,增加了了向导式系统,用于识别树中的基因复制事件,并且重新考虑树资源管理器,以便可以显示多达100k类群的树。

【功能特点】

  1、【序列分析】

  系统发育推论

  型号选择

  约会和时钟

  祖传国家

  选择和测试

  序列比对

  2、【统计方法】

  最大似然

  距离方法

  普通最小二乘

  最大的简约

  复合似然

  贝叶斯

  3、【强大的视觉工具】

  对齐/跟踪编辑器

  树探索者

  数据探索者

  传奇发电机

  基因复制向导

  时间树向导

【使用教程】

  1、首先根据提示安装好软件之后,准备需要建树的序列,并将序列保存为fasta格式。

  2、打开MEGA7,点击Align--Edit/built Alignment,选择Create a new alignment,点击ok。

  3、打开刚刚保存下来的fasta序列。

  4、点击Alignment –Align by ClustalW ,选择所有序列,出现下图,参数根据需求修改,在这我们就直接选择默认,点击ok。

  5、比对完成后,点击Data –Phylogenetic Analysis,出现下图坐标箭头指向的两个按钮。

  6、点击Phylogeny,有5个构建进化树的方法,一般选择MaximumLikehood,最大似然法、Neighbor-Joining,邻接法和Minimum-Evolution,最小进化法方法,在此选择选择Neighbor-Joining,邻接法建树。

  7、在Test of Phylogeny 选择Bootstrapmethod; No.ofBootstrap replications 输入2000; Mode/Method 核酸选择Maximum Composite Likehood, 氨基酸序列选择Poisson model; Rates among sites 选择Uniform rates; Gaps/Missing Data Treatment 选择Compeledeletion, 点击Compute得到下面结果,根据自己的需求对树进行修饰。

本文到此分享完毕,希望对大家有所帮助。

相关阅读
最新更新
热门排行